Drug Design : Economisons sur la conception des traitements thérapeutiques
Drug Design
L’étape de recherche et de développement de nouveaux médicaments est un processus long, coûteux et avec un taux d’échec important. En effet, il est estimé en moyenne que pour 10 000 molécules criblées, une seule aboutira à une Autorisation de Mise sur le Marché (A.M.M.) sachant que son développement aura duré de 10 à 15 ans et aura coûté par exemple, en oncologie, de 1,5 à 2,6 Milliards de dollars.
L’une des alternatives moins coûteuse en temps et financièrement est le « drug design ». Le drug design est ainsi l’art de créer de nouveaux médicaments en concevant des composés qui interagissent de manière sélective avec des cibles biologiques spécifiques, telles que des protéines ou des enzymes impliquées dans des pathologies.
Objectifs du Drug Design chez Absolute RXD
Chez Absolute RXD, nous maîtrisons des logiciels complexes tels que des outils de modélisation moléculaire, de simulation et de visualisation, adaptés aux besoins spécifiques du drug design.
Nous explorons et utilisons également des techniques d’apprentissage automatique pour améliorer la précision des prédictions, identifier des relations structure-activité et accélérer le processus de découverte de médicaments.
De même, nous mettons au point des méthodes de criblage virtuel hautement performantes pour filtrer rapidement de vastes bibliothèques de composés chimiques et identifier les candidats les plus prometteurs.
Enfin, nous intégrons des approches de validation expérimentale pour évaluer la fiabilité et la pertinence des résultats informatiques et affiner les modèles prédictifs.
Avantages du Drug Design pour votre organisation
- Nous disposons d’un savoir-faire pour découvrir de nouveaux médicaments plus rapidement et plus efficacement.
- Nous utilisons des bases de données intégrées riches en informations, qui permettent d'accélérer la recherche et la conception de médicaments de manière robuste.
- Nous avons une approche personnalisée et flexible pour répondre à vos besoins spécifiques, en adaptant nos services de drug design en fonction de leurs objectifs et de leur domaine thérapeutique.
- Notre approche informatique et computationnelle peut considérablement réduire les coûts de recherche et développement, tout en accélérant le processus de découverte de médicaments, permettant ainsi une mise sur le marché plus rapide.
- Nous permettons un accès privilégié aux dernières avancées en matière de recherche scientifique et de technologies émergentes dans le domaine du drug design, ce qui vous permettra de rester en tête dans le domaine.
- Nous ouvrons de nouvelles voies thérapeutiques pour des maladies encore non traitées ou mal soignées.
Drug Design et cas d'usage concret
Le projet sur lequel nous avons travaillé
Cette méthodologie consiste ainsi à trouver une nouvelle indication thérapeutique pour des « drug substances » dont le développement a été interrompu ou qui n’ont pas été approuvées dans leur indication initiale.
Un exemple très concret de l’application de cette méthode est la pandémie mondiale lié au COVID19 ces dernières années. En effet, dans l’attente de l’AMM de vaccins à ARN messager ou d’autres technologies biomédicales, le « drug repurposing » avait toute sa place pour trouver des traitements déjà existants pour limiter les effets du virus SARSCOV2 chez les personnes infectées.
En vue du grand nombre de données disponibles en open source ou privées, la difficulté principale est de screener un grand nombre de « Drug substances » dans ces bases de données et d’expliquer de manière rationnelle les résultats obtenus. La science des données est donc l’outil adapté pour résoudre ce type de problème.
Objectif du projet
Un projet collaboratif
Ce premier projet a permis de travailler en collaboration avec une équipe pluridisciplinaire comprenant des professionnels de la santé (pharmaciens, chercheurs,…) et des professionnels issus de l’IT (développeurs, bio-informaticiens, …). Ce travail scientifique s’est conclu par un datathon organisé sur 48 heures dans lequel les résultats de « drug repurposing » ont été présentés finalement à une variété d’acteurs du monde de la santé.
Contexte biologique
Afin d’atteindre notre objectif, nous avons notamment travaillé sur les éléments suivants :
• Identification des partenaires d’interaction pour une cible thérapeutique impliquée dans une voie physiologique donnée.
• Identification du ou des sites actifs pouvant induire une réponse pharmacologique.
• Screening des molécules disposant d’une homologie structurelle.
• Tri des molécules identifiés selon des variables thermodynamiques et réactionnelles.
• Sélection des candidats ayant une A.M.M. actuellement validée par des organismes de la santé
Résultats et conclusion
Nous avons ainsi identifié 3 leviers principaux sur lesquels travailler :
• VX-702
• Dilmapimod
• Binimetinib
- Nous avons confirmé notre modèle sachant qu’une majorité des molécules identifiées avaient fait ou faisait l’objet d’études cliniques au moment du projet.
- Nous avons cherché à expliquer rationnellement les résultats obtenus grâce à la littérature médicale et pharmacologique et émis ainsi de nouvelles hypothèses de recherche quant à certaines molécules non encore étudiées dans la lutte contre le COVID19.
Dans le cadre de projets de R&D similaires au sein de votre organisation, nous pouvons approfondir ce type de projet en croisant nos résultats théoriques avec vos bases de données en recherche clinique ou en pharmacologie médicale.